為了與一般的普通食品相區(qū)別，綠色食品實(shí)行標(biāo)志管理。綠色食品標(biāo)志由特定的圖形來表示。綠色食品標(biāo)志圖形由三部分構(gòu)成：上方的太陽、下方的葉片和中心的蓓蕾。標(biāo)志圖形為正圓形，意為保護(hù)、安全。整個(gè)圖形描繪了一幅明媚陽光照耀下的和諧生機(jī)，告訴人們綠色食品是出自純凈、良好生態(tài)環(huán)境的安全、無污染食品，能給人們帶來蓬勃的生命力。綠色食品標(biāo)志還提醒人們要保護(hù)環(huán)境和防止污染，通過改善人與環(huán)境的關(guān)系，創(chuàng)造自然界新的和諧。

　　綠色食品標(biāo)志商標(biāo)作為特定的產(chǎn)品質(zhì)量證明商標(biāo)，1996年已由中國綠色食品發(fā)展中心在國家工商行政管理局注冊(cè)，從而使綠色食品標(biāo)志商標(biāo)專用權(quán)受《中華人民共和國商標(biāo)法》保護(hù)，這樣既有利于約束和規(guī)范企業(yè)的經(jīng)濟(jì)行為，又有利于保護(hù)廣大消費(fèi)者的利益。目前，綠色食品商標(biāo)已在國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局商標(biāo)局注冊(cè)的有以下十種形式。

　　2019年，綠色食品標(biāo)志圖形及綠色食品中、英文組合著作權(quán)于2019年4月17日在國家版權(quán)局登記保護(hù)成功，有效期為50年。 

　　標(biāo)志使用管理 

　　綠色食品實(shí)施商標(biāo)使用許可制度，使用有效期為三年。在有效使用期內(nèi)，綠色食品管理機(jī)構(gòu)每年對(duì)用標(biāo)企業(yè)實(shí)施年檢，組織綠色食品產(chǎn)品質(zhì)量定點(diǎn)檢測(cè)機(jī)構(gòu)對(duì)產(chǎn)品質(zhì)量進(jìn)行抽檢，并進(jìn)行綜合考核評(píng)定，合格者繼續(xù)許可使用綠色食品標(biāo)志，不合格者限期整改或取消綠色食品標(biāo)志使用權(quán)。

　　市場(chǎng)監(jiān)察 

　　加強(qiáng)對(duì)用標(biāo)產(chǎn)品的監(jiān)督檢查，配合工商和技術(shù)監(jiān)督等部門清理、整頓和規(guī)范綠色食品市場(chǎng)，打擊假冒綠色食品，糾正企業(yè)不規(guī)范用標(biāo)行為，維護(hù)綠色食品生產(chǎn)經(jīng)營者和消費(fèi)者合法權(quán)益。

　　產(chǎn)品公告 

　　定期在指定的國家級(jí)新聞媒體和官方網(wǎng)站上公告新認(rèn)證的和被取消的綠色食品產(chǎn)品。

　　社會(huì)監(jiān)督 

　　綠色食品管理機(jī)構(gòu)和企業(yè)自覺接受新聞媒體和社會(huì)各界的監(jiān)督，做到公正、公平、公開。